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Re: syntax error

David Marso
Administrator
Post a few records NOT THE ENTIRE DATA FILE!!!
These should have the exemplars and the NUMBER WHICH IS REPRESENTED!
Seem to be having trouble comprehending what people have already asked you several times.
REREAD THE THREAD!
Please reply to the list and not to my personal email.
Those desiring my consulting or training services please feel free to email me.
---
"Nolite dare sanctum canibus neque mittatis margaritas vestras ante porcos ne forte conculcent eas pedibus suis."
Cum es damnatorum possederunt porcos iens ut salire off sanguinum cliff in abyssum?"
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Re: syntax error

David Marso
Administrator
In reply to this post by Maguin, Eugene


Now I'm just showing off ;-)
DATA LIST / p (A8).
BEGIN DATA
SM(24:1)
END DATA.
COMPUTE p=REPLACE(REPLACE(CHAR.SUBSTR(REPLACE(p,"("," "),4),")"," "),":"," ").
COMPUTE p1=NUMBER(CHAR.SUBSTR(p,1,CHAR.INDEX(p," ")-1),F2)/NUMBER(CHAR.SUBSTR(p,CHAR.INDEX(p," ")+1),F2).
LIST p1 .


  p1
 
     24.00
 
 
Number of cases read:  1    Number of cases listed:  1
Maguin, Eugene wrote
This still isn’t a very good explanation because it hasn’t been explained how or why the BH procedure is appropriate to these data.
Specific example.

Mass     CompoundFormula    p             PCa        i        q        m    crit     test

813.7    C47H93N2        SM(24:1)      .22      354      .05      354 .050000        .

You want to convert the value of p from string to numeric. Let’s say p is a8. The meaning of ’24:1’ is undefined. Let’s say it is a concentration or mixing ratio as in 24 units of ‘x’ to 1 unit of ‘y’. (David, you’re better at this) but here is mine.
Compute lp=char.index(p,’(‘).
Compute cc= char.index(p,’:‘).
Compute rp= char.index(p,’)‘).
Do If (lp gt and cc gt 0 and rp gt 0).
+  Compute pnum=number(char.substr(p,lp+1,cc-lp-1),f2.0)/number(char.substr(p,cc+1,rp-cc-1),f2.0).
End if.

So there you go. Pnum is a number. How does that number, which for this case is 24, fit into the BH computation?

Gene Maguin

Eunkum, I just saw your latest post. How does that relate to the current problem thread. Feels like a moving target to me.



From: SPSSX(r) Discussion [mailto:[hidden email]] On Behalf Of eunkum
Sent: Wednesday, June 15, 2016 2:02 PM
To: [hidden email]
Subject: Re: syntax error

P means lipid species that are from groups (e.g., cholester (CE), dihydrosphingomyelin (DSM), phosphatidylcholine (PC), egg phosphatidylcholine (ePC) and egg phoshphatidylethanolamine (ePE), SM). Thus, P is string variable. I want to transform it into numeric variable. PCa means prostate cancer. I want to identify lipids that are correlated with prostate cancer.

On Wed, Jun 15, 2016 at 1:54 PM, Bruce Weaver [via SPSSX Discussion] <[hidden email]</user/SendEmail.jtp?type=node&node=5732421&i=0>> wrote:
You have not explained what the values of your p-variable mean.

Q. What does "SM(22:1)" mean?

Nor have you explained what the PCa variable is showing.  Are those p-values?  If not, what are they?  Is your variable p related to your PCa variable somehow?  If so, how?

I think that no one will be able to help you until you explain what these variables are, and what their values indicate.

eunkum wrote
Thank you for your response. I want to compare PCa and p. I want to
identify p that is statistically associated with PCa.

Yes. p is string value that has values like "SM(22:1)". I want to transform
it into numeric variable so I can identify p that is statistically
associated with PCa.

On Wed, Jun 15, 2016 at 11:42 AM, Rich Ulrich <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=5732419&i=0>> wrote:

> Yes. If you are going to compare p to a number "crit", then p needs to be
> a number.
>
> From what I can tell, p has values like "SM(22:1)"  and it is not obvious
> to me
> what number you want to transform it to.
>
> Maybe you intended to compare the number in PCa to crit?
>
> --
> Rich Ulrich
>
--
Bruce Weaver
[hidden email]</user/SendEmail.jtp?type=node&node=5732421&i=1>
http://sites.google.com/a/lakeheadu.ca/bweaver/

"When all else fails, RTFM."

NOTE: My Hotmail account is not monitored regularly.
To send me an e-mail, please use the address shown above.

________________________________
If you reply to this email, your message will be added to the discussion below:
http://spssx-discussion.1045642.n5.nabble.com/syntax-error-tp5732410p5732419.html
To unsubscribe from syntax error, click here.
NAML<http://spssx-discussion.1045642.n5.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_viewer&id=instant_html%21nabble%3Aemail.naml&base=nabble.naml.namespaces.BasicNamespace-nabble.view.web.template.NabbleNamespace-nabble.view.web.template.NodeNamespace&breadcrumbs=notify_subscribers%21nabble%3Aemail.naml-instant_emails%21nabble%3Aemail.naml-send_instant_email%21nabble%3Aemail.naml>


________________________________
View this message in context: Re: syntax error<http://spssx-discussion.1045642.n5.nabble.com/syntax-error-tp5732410p5732421.html>
Sent from the SPSSX Discussion mailing list archive<http://spssx-discussion.1045642.n5.nabble.com/> at Nabble.com.
===================== To manage your subscription to SPSSX-L, send a message to [hidden email]<mailto:[hidden email]> (not to SPSSX-L), with no body text except the command. To leave the list, send the command SIGNOFF SPSSX-L For a list of commands to manage subscriptions, send the command INFO REFCARD

=====================
To manage your subscription to SPSSX-L, send a message to
[hidden email] (not to SPSSX-L), with no body text except the
command. To leave the list, send the command
SIGNOFF SPSSX-L
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INFO REFCARD
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Re: syntax error

Maguin, Eugene
In reply to this post by eunkum
Your problem is becoming a listserv miniseries. Let's back up, maybe way back. You originally posted a list of 354 records of which these are the first five.
Mass     CompoundFormula    p             PCa        i        q        m    crit     test

813.7    C47H93N2        SM(24:1)      .22      354      .05      354   .050000        .
815.7    C47H95N2        SM(24:0)      .06      353      .05      354   .049859        .
785.6    C45H89N2        SM(22:1)      .00      352      .05      354   .049718        .
787.7    C45H91N2        SM(22:0)      .08      351      .05      354   .049576        .
729.6    C41H81N2        SM(18:1)      .05      350      .05      354   .049435        .

We now know that PCa refers to prostate cancer but we don't know, or I don't recall seeing, what the values of PCa refer to.
Mass and CompoundFormula seem to be irrelevant to the problem. But is that really true?
You said that P means lipid species that are from groups (e.g., cholester (CE), dihydrosphingomyelin (DSM), phosphatidylcholine (PC), egg phosphatidylcholine (ePC) and egg phoshphatidylethanolamine (ePE), SM). I believe you also said that string '(aa:b)' means 'aa' atoms in a 'b' bond.

I'd pretty much guess you are wearing people out and they are going to stop responding. So, tell us what the values of PCa mean and how they were computed. Tell us the design that generated these data. You want to compute odds ratios (and Bruce and David have been around the block with you several times already on that topic). I hope to God you know that odds ratio computations require a 2x2 table of two dichotomous variables with a greater than one number of cases in each cell OR a dichotomous DV and a continuous predictor.

Gene Maguin




-----Original Message-----
From: SPSSX(r) Discussion [mailto:[hidden email]] On Behalf Of eunkum
Sent: Wednesday, June 15, 2016 11:18 AM
To: [hidden email]
Subject: syntax error

I used the following syntax to run false discovery rate.

SORT CASES by p (a).
COMPUTE i=$casenum.
SORT CASES by i (d).
COMPUTE q=.05.
COMPUTE m=max(i,lag(m)).
COMPUTE crit=q*i/m.
COMPUTE test=(p le crit).
COMPUTE test=max(test,lag(test)).
FORMATS i m test(f8.0) q (f8.2) crit(f8.6).
VALUE LABELS test 1 'Significant' 0 'Not Significant'.
LIST.

I got the following error.

Error # 4305 in column 29.  Text: )
A relational operator may have two numeric operands or two character string operands.  To compare a character string to a numeric quantity, consider using the STRING or NUMBER function.
Execution of this command stops.
compute test=max(test,lag(test)).
execute.
formats i m test(f8.0) q (f8.2) crit(f8.6).
value labels test 1 'Significant' 0 'Not Significant'.
SORT CASES by p (a).

I got the following output. p is string variable. Do I need to transform p into numeric variable? If so, how can I do it?

Mass     CompoundFormula    p             PCa        i        q        m    
crit     test

813.7    C47H93N2        SM(24:1)      .22      354      .05      354
.050000        .
815.7    C47H95N2        SM(24:0)      .06      353      .05      354
.049859        .
785.6    C45H89N2        SM(22:1)      .00      352      .05      354
.049718        .
787.7    C45H91N2        SM(22:0)      .08      351      .05      354
.049576        .
729.6    C41H81N2        SM(18:1)      .05      350      .05      354
.049435        .
731.6    C41H83N2        SM(18:0)      .10      349      .05      354
.049294        .
701.5    C39H77N2        SM(16:1)      .06      348      .05      354
.049153        .
703.6    C39H79N2        SM(16:0)      .59      347      .05      354
.049011        .
886.6    C50H80O1        PS(44:9)      .00      346      .05      354
.048870        .
888.6    C50H82O1        PS(44:8)      .00      345      .05      354
.048729        .
890.6    C50H84O1        PS(44:7)      .00      344      .05      354
.048588        .
892.6    C50H86O1        PS(44:6)      .00      343      .05      354
.048446        .
894.6    C50H88O1        PS(44:5)      .00      342      .05      354
.048305        .
896.6    C50H90O1        PS(44:4)      .00      341      .05      354
.048164        .
898.6    C50H92O1        PS(44:3)      .00      340      .05      354
.048023        .
900.7    C50H94O1        PS(44:2)      .00      339      .05      354
.047881        .
880.5    C50H74O1        PS(44:12      .00      338      .05      354
.047740        .
882.5    C50H76O1        PS(44:11      .00      337      .05      354
.047599        .
884.5    C50H78O1        PS(44:10      .00      336      .05      354
.047458        .
858.5    C48H76O1        PS(42:9)      .00      335      .05      354
.047316        .
860.5    C48H78O1        PS(42:8)      .00      334      .05      354
.047175        .
862.6    C48H80O1        PS(42:7)      .00      333      .05      354
.047034        .
864.6    C48H82O1        PS(42:6)      .00      332      .05      354
.046893        .
866.6    C48H84O1        PS(42:5)      .00      331      .05      354
.046751        .
854.5    C48H72O1        PS(42:11      .00      330      .05      354
.046610        .
856.5    C48H74O1        PS(42:10      .00      329      .05      354
.046469        .
832.5    C46H74O1        PS(40:8)      .00      328      .05      354
.046328        .
834.5    C46H76O1        PS(40:7)      .00      327      .05      354
.046186        .
836.5    C46H78O1        PS(40:6)      .00      326      .05      354
.046045        .
838.6    C46H80O1        PS(40:5)      .00      325      .05      354
.045904        .
840.6    C46H82O1        PS(40:4)      .00      324      .05      354
.045763        .
842.6    C46H84O1        PS(40:3)      .00      323      .05      354
.045621        .
844.6    C46H86O1        PS(40:2)      .00      322      .05      354
.045480        .
846.6    C46H88O1        PS(40:1)      .00      321      .05      354
.045339        .
806.5    C44H72O1        PS(38:7)      .00      320      .05      354
.045198        .
808.5    C44H74O1        PS(38:6)      .00      319      .05      354
.045056        .
810.5    C44H76O1        PS(38:5)      .00      318      .05      354
.044915        .
812.5    C44H78O1        PS(38:4)      .00      317      .05      354
.044774        .
814.6    C44H80O1        PS(38:3)      .00      316      .05      354
.044633        .
816.6    C44H82O1        PS(38:2)      .00      315      .05      354
.044492        .
818.6    C44H84O1        PS(38:1)      .00      314      .05      354
.044350        .
820.6    C44H86O1        PS(38:0)      .00      313      .05      354
.044209        .
780.5    C42H70O1        PS(36:6)      .00      312      .05      354
.044068        .
782.5    C42H72O1        PS(36:5)      .00      311      .05      354
.043927        .
784.5    C42H74O1        PS(36:4)      .00      310      .05      354
.043785        .
786.5    C42H76O1        PS(36:3)      .00      309      .05      354
.043644        .
788.5    C42H78O1        PS(36:2)      .00      308      .05      354
.043503        .
790.6    C42H80O1        PS(36:1)      .00      307      .05      354
.043362        .
792.6    C42H82O1        PS(36:0)      .00      306      .05      354
.043220        .
756.5    C40H70O1        PS(34:4)      .00      305      .05      354
.043079        .
758.5    C40H72O1        PS(34:3)      .00      304      .05      354
.042938        .
760.5    C40H74O1        PS(34:2)      .00      303      .05      354
.042797        .
762.5    C40H76O1        PS(34:1)      .00      302      .05      354
.042655        .
764.5    C40H78O1        PS(34:0)      .00      301      .05      354
.042514        .
734.5    C38H72O1        PS(32:1)      .00      300      .05      354
.042373        .
736.5    C38H74O1        PS(32:0)      .00      299      .05      354
.042232        .
978.6    C53H85O1        PI(44:9)      .00      298      .05      354
.042090        .
980.6    C53H87O1        PI(44:8)      .00      297      .05      354
.041949        .
982.6    C53H89O1        PI(44:7)      .00      296      .05      354
.041808        .
984.6    C53H91O1        PI(44:6)      .00      295      .05      354
.041667        .
986.6    C53H93O1        PI(44:5)      .00      294      .05      354
.041525        .
988.7    C53H95O1        PI(44:4)      .00      293      .05      354
.041384        .
990.7    C53H97O1        PI(44:3)      .00      292      .05      354
.041243        .
992.7    C53H99O1        PI(44:2)      .00      291      .05      354
.041102        .
972.5    C53H79O1        PI(44:12      .00      290      .05      354
.040960        .
974.5    C53H81O1        PI(44:11      .00      289      .05      354
.040819        .
976.6    C53H83O1        PI(44:10      .00      288      .05      354
.040678        .
950.5    C51H81O1        PI(42:9)      .00      287      .05      354
.040537        .
952.6    C51H83O1        PI(42:8)      .00      286      .05      354
.040395        .
954.6    C51H85O1        PI(42:7)      .00      285      .05      354
.040254        .
956.6    C51H87O1        PI(42:6)      .00      284      .05      354
.040113        .
958.6    C51H89O1        PI(42:5)      .00      283      .05      354
.039972        .
960.6    C51H91O1        PI(42:4)      .00      282      .05      354
.039831        .
962.6    C51H93O1        PI(42:3)      .00      281      .05      354
.039689        .
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802.7    C46H92O7        ePC(38:1      .01       39      .05      354
.005508        .
804.7    C46H94O7        ePC(38:0      .00       38      .05      354
.005367        .
766.6    C44H80O7        ePC(36:5      .01       37      .05      354
.005226        .
768.6    C44H82O7        ePC(36:4      .02       36      .05      354
.005085        .
770.6    C44H84O7        ePC(36:3      .01       35      .05      354
.004944        .
772.6    C44H86O7        ePC(36:2      .02       34      .05      354
.004802        .
774.6    C44H88O7        ePC(36:1      .02       33      .05      354
.004661        .
776.6    C44H90O7        ePC(36:0      .00       32      .05      354
.004520        .
740.6    C42H78O7        ePC(34:4      .00       31      .05      354
.004379        .
742.6    C42H80O7        ePC(34:3      .01       30      .05      354
.004237        .
744.6    C42H82O7        ePC(34:2      .02       29      .05      354
.004096        .
746.6    C42H84O7        ePC(34:1      .01       28      .05      354
.003955        .
748.6    C42H86O7        ePC(34:0      .00       27      .05      354
.003814        .
714.5    C40H76O7        ePC(32:3      .00       26      .05      354
.003672        .
716.6    C40H78O7        ePC(32:2      .00       25      .05      354
.003531        .
718.6    C40H80O7        ePC(32:1      .01       24      .05      354
.003390        .
720.6    C40H82O7        ePC(32:0      .00       23      .05      354
.003249        .
817.7    C47H97N2        DSM(24:0      .00       22      .05      354
.003107        .
789.7    C45H93N2        DSM(22:0      .02       21      .05      354
.002966        .
733.6    C41H85N2        DSM(18:0      .00       20      .05      354
.002825        .
705.6    C39H81N2        DSM(16:0      .02       19      .05      354
.002684        .
714.6168 C49H80NO        C22:6 CE      .23       18      .05      354
.002542        .
716.6324 C49H82NO        C22:5 CE      .02       17      .05      354
.002401        .
718.6480 C49H84NO        C22:4 CE      .01       16      .05      354
.002260        .
688.6012 C47H78NO        C20:5 CE      .34       15      .05      354
.002119        .
690.6168 C47H80NO        C20:4 CE     3.31       14      .05      354
.001977        .
692.6324 C47H82NO        C20:3 CE      .28       13      .05      354
.001836        .
694.6480 C47H84NO        C20:2 CE      .00       12      .05      354
.001695        .
696.6636 C47H86NO        C20:1 CE      .05       11      .05      354
.001554        .
698.6792 C47H88NO        C20:0 CE      .30       10      .05      354
.001412        .
682.6480 C46H84NO        C19:1 CE      .21        9      .05      354
.001271        .
684.6636 C46H86NO        C19:0 CE      .01        8      .05      354
.001130        .
664.6012 C45H78NO        C18:3 CE      .44        7      .05      354
.000989        .
666.6168 C45H80NO        C18:2 CE    15.38        6      .05      354
.000847        .
668.6324 C45H82NO        C18:1 CE     2.52        5      .05      354
.000706        .
670.6480 C45H84NO        C18:0 CE      .00        4      .05      354
.000565        .
640.6012 C43H78NO        C16:1 CE      .28        3      .05      354
.000424        .
642.6168 C43H80NO        C16:0 CE      .41        2      .05      354
.000282        .
614.5856 C41H76NO        C14:0 CE      .01        1      .05      354
.000141        .


Number of cases read:  354    Number of cases listed:  354





--
View this message in context: http://spssx-discussion.1045642.n5.nabble.com/syntax-error-tp5732410.html
Sent from the SPSSX Discussion mailing list archive at Nabble.com.

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Re: syntax error

eunkum
The values of PCa refer to the medical history of patients diagnosed with Prostate cancer. It was calculated by averaging PC10(the medical history of patients diagnosed with PCaprostate cancer) and PC77(prostate cancer77). Mass and CompoundFormula are irrelevant to the problem. In the new data in my previous email, I recoded 0 (absent) for the value of 0-1 of PCa and 1 (present) for the value of 1-20 of PCa. P means lipid species that are from groups (e.g., cholester (CE), dihydrosphingomyelin (DSM), phosphatidylcholine (PC), egg phosphatidylcholine (ePC) and egg phoshphatidylethanolamine (ePE), SM). String '(aa:b)' means 'aa' atoms in a 'b' bond. I identified 31 lipids by the FDR. And I want to calculate odds ratio of these 31 lipids with PCa.

I know that odds ratio computations require a 2x2 table of two dichotomous variables with a greater than one number of cases in each cell OR a dichotomous DV and a continuous predictor. That's why I am asking if there is any way for me to calculate odds ratio of 31 lipids. I heard that I can get odds ratio of 31 lipids by using logistic regression. I did logistic regression. But I got the following: I could not get the odds ratio.

Variables not in the Equation                   
                                                           Score    df    Sig.
Step 0    Variables    CompoundName    33.000    32    .418
        CompoundName(1)    10.312    1    .001
        CompoundName(2)    .103    1    .748
        CompoundName(3)    .103    1    .748
        CompoundName(4)    .103    1    .748
        CompoundName(5)    .103    1    .748
        CompoundName(6)    10.312    1    .001
        CompoundName(7)    .103    1    .748
        CompoundName(8)    .103    1    .748
        CompoundName(9)    .103    1    .748
        CompoundName(10)    .103    1    .748
        CompoundName(11)    .103    1    .748
        CompoundName(12)    .103    1    .748
        CompoundName(13)    .103    1    .748
        CompoundName(14)    .103    1    .748
        CompoundName(15)    .103    1    .748
        CompoundName(16)    .103    1    .748
        CompoundName(17)    .103    1    .748
        CompoundName(18)    .103    1    .748
        CompoundName(19)    .103    1    .748
        CompoundName(20)    .103    1    .748
        CompoundName(21)    .103    1    .748
        CompoundName(22)    .103    1    .748
        CompoundName(23)    .103    1    .748
        CompoundName(24)    .103    1    .748
        CompoundName(25)    .103    1    .748
        CompoundName(26)    .103    1    .748
        CompoundName(27)    .103    1    .748
        CompoundName(28)    .103    1    .748
        CompoundName(29)    .103    1    .748
        CompoundName(30)    .103    1    .748
        CompoundName(31)    .103    1    .748
        CompoundName(32)    .103    1    .748
    Overall Statistics        33.000    32    .418





On Thu, Jun 16, 2016 at 1:45 PM, Maguin, Eugene [via SPSSX Discussion] <[hidden email]> wrote:
Your problem is becoming a listserv miniseries. Let's back up, maybe way back. You originally posted a list of 354 records of which these are the first five.
Mass     CompoundFormula    p             PCa        i        q        m    crit     test

813.7    C47H93N2        SM(24:1)      .22      354      .05      354   .050000        .
815.7    C47H95N2        SM(24:0)      .06      353      .05      354   .049859        .
785.6    C45H89N2        SM(22:1)      .00      352      .05      354   .049718        .
787.7    C45H91N2        SM(22:0)      .08      351      .05      354   .049576        .
729.6    C41H81N2        SM(18:1)      .05      350      .05      354   .049435        .

We now know that PCa refers to prostate cancer but we don't know, or I don't recall seeing, what the values of PCa refer to.
Mass and CompoundFormula seem to be irrelevant to the problem. But is that really true?
You said that P means lipid species that are from groups (e.g., cholester (CE), dihydrosphingomyelin (DSM), phosphatidylcholine (PC), egg phosphatidylcholine (ePC) and egg phoshphatidylethanolamine (ePE), SM). I believe you also said that string '(aa:b)' means 'aa' atoms in a 'b' bond.

I'd pretty much guess you are wearing people out and they are going to stop responding. So, tell us what the values of PCa mean and how they were computed. Tell us the design that generated these data. You want to compute odds ratios (and Bruce and David have been around the block with you several times already on that topic). I hope to God you know that odds ratio computations require a 2x2 table of two dichotomous variables with a greater than one number of cases in each cell OR a dichotomous DV and a continuous predictor.

Gene Maguin




-----Original Message-----
From: SPSSX(r) Discussion [mailto:[hidden email]] On Behalf Of eunkum
Sent: Wednesday, June 15, 2016 11:18 AM
To: [hidden email]
Subject: syntax error

I used the following syntax to run false discovery rate.

SORT CASES by p (a).
COMPUTE i=$casenum.
SORT CASES by i (d).
COMPUTE q=.05.
COMPUTE m=max(i,lag(m)).
COMPUTE crit=q*i/m.
COMPUTE test=(p le crit).
COMPUTE test=max(test,lag(test)).
FORMATS i m test(f8.0) q (f8.2) crit(f8.6).
VALUE LABELS test 1 'Significant' 0 'Not Significant'.
LIST.

I got the following error.

Error # 4305 in column 29.  Text: )
A relational operator may have two numeric operands or two character string operands.  To compare a character string to a numeric quantity, consider using the STRING or NUMBER function.
Execution of this command stops.
compute test=max(test,lag(test)).
execute.
formats i m test(f8.0) q (f8.2) crit(f8.6).
value labels test 1 'Significant' 0 'Not Significant'.
SORT CASES by p (a).

I got the following output. p is string variable. Do I need to transform p into numeric variable? If so, how can I do it?

Mass     CompoundFormula    p             PCa        i        q        m    
crit     test

813.7    C47H93N2        SM(24:1)      .22      354      .05      354
.050000        .
815.7    C47H95N2        SM(24:0)      .06      353      .05      354
.049859        .
785.6    C45H89N2        SM(22:1)      .00      352      .05      354
.049718        .
787.7    C45H91N2        SM(22:0)      .08      351      .05      354
.049576        .
729.6    C41H81N2        SM(18:1)      .05      350      .05      354
.049435        .
731.6    C41H83N2        SM(18:0)      .10      349      .05      354
.049294        .
701.5    C39H77N2        SM(16:1)      .06      348      .05      354
.049153        .
703.6    C39H79N2        SM(16:0)      .59      347      .05      354
.049011        .
886.6    C50H80O1        PS(44:9)      .00      346      .05      354
.048870        .
888.6    C50H82O1        PS(44:8)      .00      345      .05      354
.048729        .
890.6    C50H84O1        PS(44:7)      .00      344      .05      354
.048588        .
892.6    C50H86O1        PS(44:6)      .00      343      .05      354
.048446        .
894.6    C50H88O1        PS(44:5)      .00      342      .05      354
.048305        .
896.6    C50H90O1        PS(44:4)      .00      341      .05      354
.048164        .
898.6    C50H92O1        PS(44:3)      .00      340      .05      354
.048023        .
900.7    C50H94O1        PS(44:2)      .00      339      .05      354
.047881        .
880.5    C50H74O1        PS(44:12      .00      338      .05      354
.047740        .
882.5    C50H76O1        PS(44:11      .00      337      .05      354
.047599        .
884.5    C50H78O1        PS(44:10      .00      336      .05      354
.047458        .
858.5    C48H76O1        PS(42:9)      .00      335      .05      354
.047316        .
860.5    C48H78O1        PS(42:8)      .00      334      .05      354
.047175        .
862.6    C48H80O1        PS(42:7)      .00      333      .05      354
.047034        .
864.6    C48H82O1        PS(42:6)      .00      332      .05      354
.046893        .
866.6    C48H84O1        PS(42:5)      .00      331      .05      354
.046751        .
854.5    C48H72O1        PS(42:11      .00      330      .05      354
.046610        .
856.5    C48H74O1        PS(42:10      .00      329      .05      354
.046469        .
832.5    C46H74O1        PS(40:8)      .00      328      .05      354
.046328        .
834.5    C46H76O1        PS(40:7)      .00      327      .05      354
.046186        .
836.5    C46H78O1        PS(40:6)      .00      326      .05      354
.046045        .
838.6    C46H80O1        PS(40:5)      .00      325      .05      354
.045904        .
840.6    C46H82O1        PS(40:4)      .00      324      .05      354
.045763        .
842.6    C46H84O1        PS(40:3)      .00      323      .05      354
.045621        .
844.6    C46H86O1        PS(40:2)      .00      322      .05      354
.045480        .
846.6    C46H88O1        PS(40:1)      .00      321      .05      354
.045339        .
806.5    C44H72O1        PS(38:7)      .00      320      .05      354
.045198        .
808.5    C44H74O1        PS(38:6)      .00      319      .05      354
.045056        .
810.5    C44H76O1        PS(38:5)      .00      318      .05      354
.044915        .
812.5    C44H78O1        PS(38:4)      .00      317      .05      354
.044774        .
814.6    C44H80O1        PS(38:3)      .00      316      .05      354
.044633        .
816.6    C44H82O1        PS(38:2)      .00      315      .05      354
.044492        .
818.6    C44H84O1        PS(38:1)      .00      314      .05      354
.044350        .
820.6    C44H86O1        PS(38:0)      .00      313      .05      354
.044209        .
780.5    C42H70O1        PS(36:6)      .00      312      .05      354
.044068        .
782.5    C42H72O1        PS(36:5)      .00      311      .05      354
.043927        .
784.5    C42H74O1        PS(36:4)      .00      310      .05      354
.043785        .
786.5    C42H76O1        PS(36:3)      .00      309      .05      354
.043644        .
788.5    C42H78O1        PS(36:2)      .00      308      .05      354
.043503        .
790.6    C42H80O1        PS(36:1)      .00      307      .05      354
.043362        .
792.6    C42H82O1        PS(36:0)      .00      306      .05      354
.043220        .
756.5    C40H70O1        PS(34:4)      .00      305      .05      354
.043079        .
758.5    C40H72O1        PS(34:3)      .00      304      .05      354
.042938        .
760.5    C40H74O1        PS(34:2)      .00      303      .05      354
.042797        .
762.5    C40H76O1        PS(34:1)      .00      302      .05      354
.042655        .
764.5    C40H78O1        PS(34:0)      .00      301      .05      354
.042514        .
734.5    C38H72O1        PS(32:1)      .00      300      .05      354
.042373        .
736.5    C38H74O1        PS(32:0)      .00      299      .05      354
.042232        .
978.6    C53H85O1        PI(44:9)      .00      298      .05      354
.042090        .
980.6    C53H87O1        PI(44:8)      .00      297      .05      354
.041949        .
982.6    C53H89O1        PI(44:7)      .00      296      .05      354
.041808        .
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.041667        .
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.041525        .
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.041384        .
990.7    C53H97O1        PI(44:3)      .00      292      .05      354
.041243        .
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.041102        .
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.040960        .
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.040395        .
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.040254        .
956.6    C51H87O1        PI(42:6)      .00      284      .05      354
.040113        .
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.039972        .
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.039831        .
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.039689        .
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.039548        .
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.039124        .
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.037853        .
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.037712        .
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.037006        .
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.036723        .
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.036582        .
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.036441        .
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.036299        .
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.033475        .
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.033051        .
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.032910        .
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.032768        .
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798.6    C45H84O8        PE(40:3)      .00      227      .05      354
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.031780        .
766.5    C43H76O8        PE(38:5)      .01      224      .05      354
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664.5    C35H70O8        PE(30:0)      .00      202      .05      354
.028531        .
634.4    C33H64O8        PE(28:1)      .00      201      .05      354
.028390        .
636.5    C33H66O8        PE(28:0)      .00      200      .05      354
.028249        .
773.6    C44H89O6        PE-Cer(2      .00      199      .05      354
.028107        .
689.5    C38H77O6        PE-Cer(1      .00      198      .05      354
.027966        .
687.5    C38H75O6        PE-Cer(1      .00      197      .05      354
.027825        .
661.5    C36H73O6        PE-Cer(1      .00      196      .05      354
.027684        .
659.5    C36H71O6        PE-Cer(1      .00      195      .05      354
.027542        .
884.6    C52H86O8        PC(44:9)      .00      194      .05      354
.027401        .
886.6    C52H88O8        PC(44:8)      .00      193      .05      354
.027260        .
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.027119        .
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750.5    C43H76O7        ePE(38:6      .00       71      .05      354
.010028        .
752.6    C43H78O7        ePE(38:5      .00       70      .05      354
.009887        .
754.6    C43H80O7        ePE(38:4      .00       69      .05      354
.009746        .
756.6    C43H82O7        ePE(38:3      .00       68      .05      354
.009605        .
758.6    C43H84O7        ePE(38:2      .00       67      .05      354
.009463        .
760.6    C43H86O7        ePE(38:1      .00       66      .05      354
.009322        .
762.6    C43H88O7        ePE(38:0      .00       65      .05      354
.009181        .
724.5    C41H74O7        ePE(36:5      .00       64      .05      354
.009040        .
726.5    C41H76O7        ePE(36:4      .00       63      .05      354
.008898        .
728.6    C41H78O7        ePE(36:3      .00       62      .05      354
.008757        .
730.6    C41H80O7        ePE(36:2      .00       61      .05      354
.008616        .
732.6    C41H82O7        ePE(36:1      .00       60      .05      354
.008475        .
734.6    C41H84O7        ePE(36:0      .00       59      .05      354
.008333        .
698.5    C39H72O7        ePE(34:4      .00       58      .05      354
.008192        .
700.5    C39H74O7        ePE(34:3      .00       57      .05      354
.008051        .
702.5    C39H76O7        ePE(34:2      .00       56      .05      354
.007910        .
704.6    C39H78O7        ePE(34:1      .00       55      .05      354
.007768        .
706.6    C39H80O7        ePE(34:0      .00       54      .05      354
.007627        .
672.5    C37H70O7        ePE(32:3      .00       53      .05      354
.007486        .
674.5    C37H72O7        ePE(32:2      .00       52      .05      354
.007345        .
676.5    C37H74O7        ePE(32:1      .00       51      .05      354
.007203        .
678.5    C37H76O7        ePE(32:0      .00       50      .05      354
.007062        .
820.6    C48H86O7        ePC(40:6      .00       49      .05      354
.006921        .
822.6    C48H88O7        ePC(40:5      .01       48      .05      354
.006780        .
824.6    C48H90O7        ePC(40:4      .00       47      .05      354
.006638        .
826.7    C48H92O7        ePC(40:3      .01       46      .05      354
.006497        .
828.7    C48H94O7        ePC(40:2      .00       45      .05      354
.006356        .
792.6    C46H82O7        ePC(38:6      .01       44      .05      354
.006215        .
794.6    C46H84O7        ePC(38:5      .02       43      .05      354
.006073        .
796.6    C46H86O7        ePC(38:4      .02       42      .05      354
.005932        .
798.6    C46H88O7        ePC(38:3      .02       41      .05      354
.005791        .
800.6    C46H90O7        ePC(38:2      .01       40      .05      354
.005650        .
802.7    C46H92O7        ePC(38:1      .01       39      .05      354
.005508        .
804.7    C46H94O7        ePC(38:0      .00       38      .05      354
.005367        .
766.6    C44H80O7        ePC(36:5      .01       37      .05      354
.005226        .
768.6    C44H82O7        ePC(36:4      .02       36      .05      354
.005085        .
770.6    C44H84O7        ePC(36:3      .01       35      .05      354
.004944        .
772.6    C44H86O7        ePC(36:2      .02       34      .05      354
.004802        .
774.6    C44H88O7        ePC(36:1      .02       33      .05      354
.004661        .
776.6    C44H90O7        ePC(36:0      .00       32      .05      354
.004520        .
740.6    C42H78O7        ePC(34:4      .00       31      .05      354
.004379        .
742.6    C42H80O7        ePC(34:3      .01       30      .05      354
.004237        .
744.6    C42H82O7        ePC(34:2      .02       29      .05      354
.004096        .
746.6    C42H84O7        ePC(34:1      .01       28      .05      354
.003955        .
748.6    C42H86O7        ePC(34:0      .00       27      .05      354
.003814        .
714.5    C40H76O7        ePC(32:3      .00       26      .05      354
.003672        .
716.6    C40H78O7        ePC(32:2      .00       25      .05      354
.003531        .
718.6    C40H80O7        ePC(32:1      .01       24      .05      354
.003390        .
720.6    C40H82O7        ePC(32:0      .00       23      .05      354
.003249        .
817.7    C47H97N2        DSM(24:0      .00       22      .05      354
.003107        .
789.7    C45H93N2        DSM(22:0      .02       21      .05      354
.002966        .
733.6    C41H85N2        DSM(18:0      .00       20      .05      354
.002825        .
705.6    C39H81N2        DSM(16:0      .02       19      .05      354
.002684        .
714.6168 C49H80NO        C22:6 CE      .23       18      .05      354
.002542        .
716.6324 C49H82NO        C22:5 CE      .02       17      .05      354
.002401        .
718.6480 C49H84NO        C22:4 CE      .01       16      .05      354
.002260        .
688.6012 C47H78NO        C20:5 CE      .34       15      .05      354
.002119        .
690.6168 C47H80NO        C20:4 CE     3.31       14      .05      354
.001977        .
692.6324 C47H82NO        C20:3 CE      .28       13      .05      354
.001836        .
694.6480 C47H84NO        C20:2 CE      .00       12      .05      354
.001695        .
696.6636 C47H86NO        C20:1 CE      .05       11      .05      354
.001554        .
698.6792 C47H88NO        C20:0 CE      .30       10      .05      354
.001412        .
682.6480 C46H84NO        C19:1 CE      .21        9      .05      354
.001271        .
684.6636 C46H86NO        C19:0 CE      .01        8      .05      354
.001130        .
664.6012 C45H78NO        C18:3 CE      .44        7      .05      354
.000989        .
666.6168 C45H80NO        C18:2 CE    15.38        6      .05      354
.000847        .
668.6324 C45H82NO        C18:1 CE     2.52        5      .05      354
.000706        .
670.6480 C45H84NO        C18:0 CE      .00        4      .05      354
.000565        .
640.6012 C43H78NO        C16:1 CE      .28        3      .05      354
.000424        .
642.6168 C43H80NO        C16:0 CE      .41        2      .05      354
.000282        .
614.5856 C41H76NO        C14:0 CE      .01        1      .05      354
.000141        .


Number of cases read:  354    Number of cases listed:  354





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Re: syntax error

Maguin, Eugene

I’m done responding to this problem. I don’t where you are located but I think you desperately need to find somebody from where you are located to work closely with you. You’re in cancer medicine/research, I’d guess; as far as I know, none of your respondents on this list are and, if I may speak for others, things you are familiar with/know about/understand, we have no knowledge of. Best wishes.

 

By the way, all of the PCa values but 3 are between 0 and 1 so the recode statement is pointless.

 

Gene Maguin

 

 

From: SPSSX(r) Discussion [mailto:[hidden email]] On Behalf Of eunkum
Sent: Thursday, June 16, 2016 2:15 PM
To: [hidden email]
Subject: Re: syntax error

 

The values of PCa refer to the medical history of patients diagnosed with Prostate cancer. It was calculated by averaging PC10(the medical history of patients diagnosed with PCaprostate cancer) and PC77(prostate cancer77). Mass and CompoundFormula are irrelevant to the problem. In the new data in my previous email, I recoded 0 (absent) for the value of 0-1 of PCa and 1 (present) for the value of 1-20 of PCa. P means lipid species that are from groups (e.g., cholester (CE), dihydrosphingomyelin (DSM), phosphatidylcholine (PC), egg phosphatidylcholine (ePC) and egg phoshphatidylethanolamine (ePE), SM). String '(aa:b)' means 'aa' atoms in a 'b' bond. I identified 31 lipids by the FDR. And I want to calculate odds ratio of these 31 lipids with PCa.

I know that odds ratio computations require a 2x2 table of two dichotomous variables with a greater than one number of cases in each cell OR a dichotomous DV and a continuous predictor. That's why I am asking if there is any way for me to calculate odds ratio of 31 lipids. I heard that I can get odds ratio of 31 lipids by using logistic regression. I did logistic regression. But I got the following: I could not get the odds ratio.

Variables not in the Equation                   
                                                           Score    df    Sig.
Step 0    Variables    CompoundName    33.000    32    .418
        CompoundName(1)    10.312    1    .001
        CompoundName(2)    .103    1    .748
        CompoundName(3)    .103    1    .748
        CompoundName(4)    .103    1    .748
        CompoundName(5)    .103    1    .748
        CompoundName(6)    10.312    1    .001
        CompoundName(7)    .103    1    .748
        CompoundName(8)    .103    1    .748
        CompoundName(9)    .103    1    .748
        CompoundName(10)    .103    1    .748
        CompoundName(11)    .103    1    .748
        CompoundName(12)    .103    1    .748
        CompoundName(13)    .103    1    .748
        CompoundName(14)    .103    1    .748
        CompoundName(15)    .103    1    .748
        CompoundName(16)    .103    1    .748
        CompoundName(17)    .103    1    .748
        CompoundName(18)    .103    1    .748
        CompoundName(19)    .103    1    .748
        CompoundName(20)    .103    1    .748
        CompoundName(21)    .103    1    .748
        CompoundName(22)    .103    1    .748
        CompoundName(23)    .103    1    .748
        CompoundName(24)    .103    1    .748
        CompoundName(25)    .103    1    .748
        CompoundName(26)    .103    1    .748
        CompoundName(27)    .103    1    .748
        CompoundName(28)    .103    1    .748
        CompoundName(29)    .103    1    .748
        CompoundName(30)    .103    1    .748
        CompoundName(31)    .103    1    .748
        CompoundName(32)    .103    1    .748
    Overall Statistics        33.000    32    .418



 

On Thu, Jun 16, 2016 at 1:45 PM, Maguin, Eugene [via SPSSX Discussion] <[hidden email]> wrote:

Your problem is becoming a listserv miniseries. Let's back up, maybe way back. You originally posted a list of 354 records of which these are the first five.
Mass     CompoundFormula    p             PCa        i        q        m    crit     test

813.7    C47H93N2        SM(24:1)      .22      354      .05      354   .050000        .
815.7    C47H95N2        SM(24:0)      .06      353      .05      354   .049859        .
785.6    C45H89N2        SM(22:1)      .00      352      .05      354   .049718        .
787.7    C45H91N2        SM(22:0)      .08      351      .05      354   .049576        .
729.6    C41H81N2        SM(18:1)      .05      350      .05      354   .049435        .

We now know that PCa refers to prostate cancer but we don't know, or I don't recall seeing, what the values of PCa refer to.
Mass and CompoundFormula seem to be irrelevant to the problem. But is that really true?
You said that P means lipid species that are from groups (e.g., cholester (CE), dihydrosphingomyelin (DSM), phosphatidylcholine (PC), egg phosphatidylcholine (ePC) and egg phoshphatidylethanolamine (ePE), SM). I believe you also said that string '(aa:b)' means 'aa' atoms in a 'b' bond.

I'd pretty much guess you are wearing people out and they are going to stop responding. So, tell us what the values of PCa mean and how they were computed. Tell us the design that generated these data. You want to compute odds ratios (and Bruce and David have been around the block with you several times already on that topic). I hope to God you know that odds ratio computations require a 2x2 table of two dichotomous variables with a greater than one number of cases in each cell OR a dichotomous DV and a continuous predictor.

Gene Maguin




-----Original Message-----
From: SPSSX(r) Discussion [mailto:[hidden email]] On Behalf Of eunkum
Sent: Wednesday, June 15, 2016 11:18 AM
To: [hidden email]
Subject: syntax error

I used the following syntax to run false discovery rate.

SORT CASES by p (a).
COMPUTE i=$casenum.
SORT CASES by i (d).
COMPUTE q=.05.
COMPUTE m=max(i,lag(m)).
COMPUTE crit=q*i/m.
COMPUTE test=(p le crit).
COMPUTE test=max(test,lag(test)).
FORMATS i m test(f8.0) q (f8.2) crit(f8.6).
VALUE LABELS test 1 'Significant' 0 'Not Significant'.
LIST.

I got the following error.

Error # 4305 in column 29.  Text: )
A relational operator may have two numeric operands or two character string operands.  To compare a character string to a numeric quantity, consider using the STRING or NUMBER function.
Execution of this command stops.
compute test=max(test,lag(test)).
execute.
formats i m test(f8.0) q (f8.2) crit(f8.6).
value labels test 1 'Significant' 0 'Not Significant'.
SORT CASES by p (a).

I got the following output. p is string variable. Do I need to transform p into numeric variable? If so, how can I do it?

Mass     CompoundFormula    p             PCa        i        q        m    
crit     test

813.7    C47H93N2        SM(24:1)      .22      354      .05      354
.050000        .

815.7    C47H95N2        SM(24:0)      .06      353      .05      354
.049859        .
785.6    C45H89N2        SM(22:1)      .00      352      .05      354
.049718        .
787.7    C45H91N2        SM(22:0)      .08      351      .05      354
.049576        .
729.6    C41H81N2        SM(18:1)      .05      350      .05      354
.049435        .
731.6    C41H83N2        SM(18:0)      .10      349      .05      354
.049294        .
701.5    C39H77N2        SM(16:1)      .06      348      .05      354
.049153        .
703.6    C39H79N2        SM(16:0)      .59      347      .05      354
.049011        .
886.6    C50H80O1        PS(44:9)      .00      346      .05      354
.048870        .
888.6    C50H82O1        PS(44:8)      .00      345      .05      354
.048729        .
890.6    C50H84O1        PS(44:7)      .00      344      .05      354
.048588        .
892.6    C50H86O1        PS(44:6)      .00      343      .05      354
.048446        .
894.6    C50H88O1        PS(44:5)      .00      342      .05      354
.048305        .
896.6    C50H90O1        PS(44:4)      .00      341      .05      354
.048164        .
898.6    C50H92O1        PS(44:3)      .00      340      .05      354
.048023        .
900.7    C50H94O1        PS(44:2)      .00      339      .05      354
.047881        .
880.5    C50H74O1        PS(44:12      .00      338      .05      354
.047740        .
882.5    C50H76O1        PS(44:11      .00      337      .05      354
.047599        .
884.5    C50H78O1        PS(44:10      .00      336      .05      354
.047458        .
858.5    C48H76O1        PS(42:9)      .00      335      .05      354
.047316        .
860.5    C48H78O1        PS(42:8)      .00      334      .05      354
.047175        .
862.6    C48H80O1        PS(42:7)      .00      333      .05      354
.047034        .
864.6    C48H82O1        PS(42:6)      .00      332      .05      354
.046893        .
866.6    C48H84O1        PS(42:5)      .00      331      .05      354
.046751        .
854.5    C48H72O1        PS(42:11      .00      330      .05      354
.046610        .
856.5    C48H74O1        PS(42:10      .00      329      .05      354
.046469        .
832.5    C46H74O1        PS(40:8)      .00      328      .05      354
.046328        .
834.5    C46H76O1        PS(40:7)      .00      327      .05      354
.046186        .
836.5    C46H78O1        PS(40:6)      .00      326      .05      354
.046045        .
838.6    C46H80O1        PS(40:5)      .00      325      .05      354
.045904        .
840.6    C46H82O1        PS(40:4)      .00      324      .05      354
.045763        .
842.6    C46H84O1        PS(40:3)      .00      323      .05      354
.045621        .
844.6    C46H86O1        PS(40:2)      .00      322      .05      354
.045480        .
846.6    C46H88O1        PS(40:1)      .00      321      .05      354
.045339        .
806.5    C44H72O1        PS(38:7)      .00      320      .05      354
.045198        .
808.5    C44H74O1        PS(38:6)      .00      319      .05      354
.045056        .
810.5    C44H76O1        PS(38:5)      .00      318      .05      354
.044915        .
812.5    C44H78O1        PS(38:4)      .00      317      .05      354
.044774        .
814.6    C44H80O1        PS(38:3)      .00      316      .05      354
.044633        .
816.6    C44H82O1        PS(38:2)      .00      315      .05      354
.044492        .
818.6    C44H84O1        PS(38:1)      .00      314      .05      354
.044350        .
820.6    C44H86O1        PS(38:0)      .00      313      .05      354
.044209        .
780.5    C42H70O1        PS(36:6)      .00      312      .05      354
.044068        .
782.5    C42H72O1        PS(36:5)      .00      311      .05      354
.043927        .
784.5    C42H74O1        PS(36:4)      .00      310      .05      354
.043785        .
786.5    C42H76O1        PS(36:3)      .00      309      .05      354
.043644        .
788.5    C42H78O1        PS(36:2)      .00      308      .05      354
.043503        .
790.6    C42H80O1        PS(36:1)      .00      307      .05      354
.043362        .
792.6    C42H82O1        PS(36:0)      .00      306      .05      354
.043220        .
756.5    C40H70O1        PS(34:4)      .00      305      .05      354
.043079        .
758.5    C40H72O1        PS(34:3)      .00      304      .05      354
.042938        .
760.5    C40H74O1        PS(34:2)      .00      303      .05      354
.042797        .
762.5    C40H76O1        PS(34:1)      .00      302      .05      354
.042655        .
764.5    C40H78O1        PS(34:0)      .00      301      .05      354
.042514        .
734.5    C38H72O1        PS(32:1)      .00      300      .05      354
.042373        .
736.5    C38H74O1        PS(32:0)      .00      299      .05      354
.042232        .
978.6    C53H85O1        PI(44:9)      .00      298      .05      354
.042090        .
980.6    C53H87O1        PI(44:8)      .00      297      .05      354
.041949        .
982.6    C53H89O1        PI(44:7)      .00      296      .05      354
.041808        .
984.6    C53H91O1        PI(44:6)      .00      295      .05      354
.041667        .
986.6    C53H93O1        PI(44:5)      .00      294      .05      354
.041525        .
988.7    C53H95O1        PI(44:4)      .00      293      .05      354
.041384        .
990.7    C53H97O1        PI(44:3)      .00      292      .05      354
.041243        .
992.7    C53H99O1        PI(44:2)      .00      291      .05      354
.041102        .
972.5    C53H79O1        PI(44:12      .00      290      .05      354
.040960        .
974.5    C53H81O1        PI(44:11      .00      289      .05      354
.040819        .
976.6    C53H83O1        PI(44:10      .00      288      .05      354
.040678        .
950.5    C51H81O1        PI(42:9)      .00      287      .05      354
.040537        .
952.6    C51H83O1        PI(42:8)      .00      286      .05      354
.040395        .
954.6    C51H85O1        PI(42:7)      .00      285      .05      354
.040254        .
956.6    C51H87O1        PI(42:6)      .00      284      .05      354
.040113        .
958.6    C51H89O1        PI(42:5)      .00      283      .05      354
.039972        .
960.6    C51H91O1        PI(42:4)      .00      282      .05      354
.039831        .
962.6    C51H93O1        PI(42:3)      .00      281      .05      354
.039689        .
964.7    C51H95O1        PI(42:2)      .00      280      .05      354
.039548        .
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.039407        .
924.5    C49H79O1        PI(40:8)      .00      278      .05      354
.039266        .
926.5    C49H81O1        PI(40:7)      .00      277      .05      354
.039124        .
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.038983        .
930.6    C49H85O1        PI(40:5)      .00      275      .05      354
.038842        .
932.6    C49H87O1        PI(40:4)      .00      274      .05      354
.038701        .
934.6    C49H89O1        PI(40:3)      .00      273      .05      354
.038559        .
936.6    C49H91O1        PI(40:2)      .00      272      .05      354
.038418        .
938.6    C49H93O1        PI(40:1)      .00      271      .05      354
.038277        .
940.7    C49H95O1        PI(40:0)      .00      270      .05      354
.038136        .
900.5    C47H79O1        PI(38:6)      .00      269      .05      354
.037994        .
902.5    C47H81O1        PI(38:5)      .00      268      .05      354
.037853        .
904.6    C47H83O1        PI(38:4)      .05      267      .05      354
.037712        .
906.6    C47H85O1        PI(38:3)      .01      266      .05      354
.037571        .
908.6    C47H87O1        PI(38:2)      .00      265      .05      354
.037429        .
910.6    C47H89O1        PI(38:1)      .00      264      .05      354
.037288        .
912.6    C47H91O1        PI(38:0)      .00      263      .05      354
.037147        .
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.036723        .
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.036582        .
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.034463        .
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.034322        .
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.034181        .
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.034040        .
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.033898        .
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.033757        .
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.033616        .
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.033475        .
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.033333        .
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.033192        .
828.6    C47H90O8        PE(42:2)      .00      234      .05      354
.033051        .
812.5    C47H74O8        PE(42:10      .00      233      .05      354
.032910        .
788.5    C45H74O8        PE(40:8)      .00      232      .05      354
.032768        .
790.5    C45H76O8        PE(40:7)      .00      231      .05      354
.032627        .
792.5    C45H78O8        PE(40:6)      .00      230      .05      354
.032486        .
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.032345        .
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666.5    C35H69O8        PA(32:0)      .00      120      .05      354
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.016808        .
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.016667        .
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504.3    C25H46O7        LPE(20:3      .00      115      .05      354
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506.3    C25H48O7        LPE(20:2      .00      114      .05      354
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508.3    C25H50O7        LPE(20:1      .00      113      .05      354
.015960        .
510.3    C25H52O7        LPE(20:0      .00      112      .05      354
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478.3    C23H44O7        LPE(18:2      .00      110      .05      354
.015537        .
480.3    C23H46O7        LPE(18:1      .00      109      .05      354
.015395        .
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670.6480 C45H84NO        C18:0 CE      .00        4      .05      354
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640.6012 C43H78NO        C16:1 CE      .28        3      .05      354
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642.6168 C43H80NO        C16:0 CE      .41        2      .05      354
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614.5856 C41H76NO        C14:0 CE      .01        1      .05      354
.000141        .

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